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當(dāng)前位置:生物測試 ?  組學(xué)平臺 ? 

宏轉(zhuǎn)錄組

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宏轉(zhuǎn)錄組

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項目介紹

宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Metatranscriptomics)的研究對象是微生物組mRNA,在獲取微生物組總RNA并去除rRNA之后,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,并構(gòu)建合適長度的插入片段文庫,對這些文庫進行雙端(Paired-end,PE)高通量測序,從而能精確定量整個菌群中具有活性的物種精細組成及其對應(yīng)功能的表達水平,進而鎖定菌群中的關(guān)鍵生物標(biāo)記物、闡明其生物學(xué)意義。

實驗流程:

分析流程:

樣品要求

1. cDNA:濃度≥20 ng/μL,總量≥1 μg,必須是雙鏈cDNA;

2. RNA:濃度≥100 ng/μL,總量≥4 μg,并確保RNA無降解;

3. 土壤、污泥等原樣,至少提供1.5g;

4. 樣品保存期間切忌反復(fù)凍融,送樣時干冰運輸。

項目案例

CAZy酶的注釋結(jié)果統(tǒng)計圖

Unigene差異表達MA圖

種水平的豐度等級曲線圖

常見問題
1、宏轉(zhuǎn)錄組測序有哪些特點?


1、直接對群落樣本中的轉(zhuǎn)錄本進行測序,真實再現(xiàn)群落的活性功能;

2、業(yè)界公認(rèn)的總RNA 提取方法和rRNA 去除技術(shù),穩(wěn)定;

3、使用Illumina NovaSeq高通量測序平臺,速度更快周期更短;

4、功能+物種,雙管齊下;拼接+不拼接,各取所長,實現(xiàn)對物種和功能的“高分辨率”精確定量;

5、根據(jù)樣本、數(shù)據(jù)特征,自動選擇分析流程,多種功能注釋數(shù)據(jù)庫可選,優(yōu)化宏基因組功能代謝譜注釋;

6、通過多種多變量統(tǒng)計分析和機器學(xué)習(xí)方法,系統(tǒng)、深入地挖掘宏轉(zhuǎn)錄組大數(shù)據(jù)中差異相關(guān)的關(guān)鍵物種和關(guān)鍵功能,識別關(guān)鍵生物標(biāo)記物。

宏轉(zhuǎn)錄組

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安心測服務(wù)說明
關(guān)閉
7天無理由
7天無理由免費復(fù)測
1. 復(fù)測保證

如果在訂單完成之后7天內(nèi)對結(jié)果存疑,可申請同條件免費復(fù)測,更換條件或者參數(shù)不能參與免費復(fù)測保障服務(wù),全程由專業(yè)團隊操作,確保結(jié)果有效性;

2. 具體細則

每單限1次復(fù)測機會,單次需小于5個樣品; 此外免費復(fù)測樣品必須為同一樣,私人定制、云視頻測試不可享受此服務(wù);

3. 注意事項

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